吉林大学商学与管理学院管理科学与工程系前身是吉林工业大学管理工程专业。作为学院历史最为悠久的系之一，于1978年恢复并招生，1981年获批硕士授权点，1985年开始招收管理信息系统专业学生，为我国信息化、数字化建设培养了大量优秀人才。2003年获批一级学科博士学位授权点，2009年获批博士后流动站。2006年获批吉林省重点学科，是吉林省“十一五”、“十二五”、“十三五”优势特色重点学科，2018年获批吉林省特色高水平学科，是教育部全国学科评估B类学科。
管理科学与工程系现有专职教师22人，其中教授10人，博士生导师10人，副教授7人，博士化率100%，并聘有多名国外资深学者担任访问教授。多年以来，本系教师在科学研究上，秉承理论研究与社会服务相结合的原则，在承担多项国家自然科学基金和部委研究课题的同时，也承担多项校企合作的重大研究项目。目前拥有企业经营模拟实验室、企业信息化工程实验室、QAD管理软件培训实验室、大学生创新创业网络模拟实训平台、电子商务实验室等多个开放式研究平台。
管理科学与工程系承担了信息管理与信息系统本科专业的建设，以及大数据管理与应用专业前3届本科专业的教学工作。研究生教育依托管理科学与工程一级学科，主要研究方向为信息系统与商务智能。此外，系里教师的研究方向还覆盖了工业工程、物流与供应链管理、电子商务、复杂系统建模与决策、商务智能与决策支持系统、大数据分析等多个相关领域。
